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根据中国的相关法律法规，《昆山出口货物退(免)税管理办法》规定，昆山出口货物退(免)税的货物必须在出口海关备案后90天内开具增值税专用发票，并在出口后1个月内向财政部门申请退(免)税。
但是在实际操作中，如有特殊情况，例如出口合同签订较晚或收汇较晚等原因导致90天内未开具专用发票，经过税务部门审批，可以延期开具专用发票，但需要提供合法的证明材料。
同时，退税时需要提供相关资料和证明文件，如果超过90天内未开具专用发票，可能会影响退税申请的批准和速度。因此建议及时办理相关手续，确保符合规定。
